Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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FgbQ8K0E8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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FgbQ8K0E8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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FgbQ8K0E8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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FgbQ8K0E8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms