Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LgsnQ8CIX8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms