Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbsnQ8CIT9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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