Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG19

Ltbp1, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp1Q8CG19 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms