Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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