Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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