Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Klhl11Q8CE33 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Klhl11Q8CE33 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Klhl11Q8CE33 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl11Q8CE33 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms