Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pramef8Q8CE24 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms