Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms