Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Atg4aQ8C9S8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Atg4aQ8C9S8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Atg4aQ8C9S8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4aQ8C9S8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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