Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms