Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21aQ8C0S4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms