Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Slx1bQ8BX32 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slx1bQ8BX32 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms