Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rbbp5Q8BX09 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rbbp5Q8BX09 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rbbp5Q8BX09 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rbbp5Q8BX09 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rbbp5Q8BX09 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rbbp5Q8BX09 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rbbp5Q8BX09 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rbbp5Q8BX09 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rbbp5Q8BX09 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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