Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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