Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Smarcal1Q8BJL0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Smarcal1Q8BJL0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Smarcal1Q8BJL0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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