Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Atg4dQ8BGV9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Atg4dQ8BGV9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Atg4dQ8BGV9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Atg4dQ8BGV9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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