Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ubash3bQ8BGG7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ubash3bQ8BGG7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ubash3bQ8BGG7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ubash3bQ8BGG7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ubash3bQ8BGG7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ubash3bQ8BGG7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ubash3bQ8BGG7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms