Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ell3Q80VR2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms