Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rims3Q80U57 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms