Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Clec18aQ7TSQ1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Clec18aQ7TSQ1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Clec18aQ7TSQ1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Clec18aQ7TSQ1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Clec18aQ7TSQ1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Clec18aQ7TSQ1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Clec18aQ7TSQ1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Clec18aQ7TSQ1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Clec18aQ7TSQ1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Clec18aQ7TSQ1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Clec18aQ7TSQ1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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