Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms