Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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