Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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