Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ParpbpQ6IRT3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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