Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Krt40Q6IFX3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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