Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q6DFW0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q6DFW0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q6DFW0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q6DFW0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms