Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Msl2Q69ZF8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Msl2Q69ZF8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Msl2Q69ZF8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Msl2Q69ZF8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Msl2Q69ZF8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Msl2Q69ZF8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Msl2Q69ZF8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Msl2Q69ZF8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Msl2Q69ZF8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Msl2Q69ZF8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Msl2Q69ZF8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Msl2Q69ZF8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Msl2Q69ZF8 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms