Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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