Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a5Q63ZW6 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms