Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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AtmQ62388 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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AtmQ62388 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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AtmQ62388 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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AtmQ62388 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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AtmQ62388 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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AtmQ62388 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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AtmQ62388 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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AtmQ62388 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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AtmQ62388 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms