Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms