Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms