Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms