Protein–RNA interactions for Protein: Q61477

Nbl1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbl1Q61477 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nbl1Q61477 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nbl1Q61477 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms