Protein–RNA interactions for Protein: Q61330

Cntn2, Contactin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn2Q61330 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn2Q61330 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn2Q61330 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn2Q61330 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn2Q61330 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn2Q61330 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cntn2Q61330 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn2Q61330 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms