Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Mre11Q61216 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mre11Q61216 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mre11Q61216 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mre11Q61216 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mre11Q61216 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mre11Q61216 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mre11Q61216 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mre11Q61216 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mre11Q61216 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mre11Q61216 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mre11Q61216 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mre11Q61216 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mre11Q61216 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms