Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Usf1Q61069 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Usf1Q61069 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Usf1Q61069 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Usf1Q61069 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Usf1Q61069 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Usf1Q61069 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Usf1Q61069 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Usf1Q61069 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Usf1Q61069 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Usf1Q61069 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Usf1Q61069 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf1Q61069 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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