Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms