Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprnQ60673 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms