Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CttnQ60598 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms