Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh2Q5SW75 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms