Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms