Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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