Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms