Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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