Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc114Q3UX62 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms