Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Tmem253Q3UNB8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Tmem253Q3UNB8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Tmem253Q3UNB8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Tmem253Q3UNB8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Tmem253Q3UNB8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tmem253Q3UNB8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tmem253Q3UNB8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tmem253Q3UNB8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tmem253Q3UNB8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tmem253Q3UNB8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tmem253Q3UNB8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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