Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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