Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U595 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U595 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U595 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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